يتألف مجلس الإدارة من 9 دول أعضاء، بما في ذلك بلد المقر، يتم انتخابهم لفترة ثلاث سنوات، قابلة للتجديد مرة واحدة، وفقا لمبدأ التوزيع الجغرافي العادل
يجتمع مجلس الإدارة مرة واحدة على الأقل في السنة ويقوم بصياغة السياسات والبرامج وكذا الإشراف الفني على أنشطة المركز.
يتم تعيين المدير العام من قبل الأمين العام على أساس قائمة محددة للمرشحين تقدم من قبل الدول الأعضاء، بالتشاور مع مجلس الإدارة وبلد المقر، لفترة أربع سنوات قابلة للتجديد مرة واحدة.
يُشرف المدير العام على إدارة المشاريع والأنشطة الخاصة بالمركز، وتنفيذ برنامج الأنشطة وفقا لأحكام النظام الأساسي الحالي والنظام الداخلي وباقي النصوص القانونية المنظمة.
أعضاء مجلس الإدارة للفترة الممتدة من 2022 إلى 2024 هم:
- جمهورية بنغلاديش الشعبية
- جمهورية الكاميرون
- جمهورية كوت ديفوار
- جمهورية إندونيسيا
- المملكة المغربية
- جمهورية نيجيريا
- جمهورية باكستان الإسلامية
- المملكة العربية السعودية
- الجمهورية التونسية